MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 10682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	CAA	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018528	CTA	4	12	1509	1520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018528	AT	3	6	1526	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018528	AGG	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018528	A	6	6	2718	2723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018528	T	7	7	2743	2749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018528	T	6	6	2791	2796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018528	TTTA	2	8	2818	2825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018528	TA	3	6	2895	2900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018528	A	6	6	8737	8742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018528	A	6	6	8745	8750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018528	A	7	7	8762	8768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018528	T	6	6	8778	8783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018528	TAA	2	6	8787	8792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018528	A	6	6	8805	8810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018528	T	6	6	8844	8849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018528	AGG	2	6	8933	8938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018528	AGGAA	2	10	9271	9280	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018528	AAAG	2	8	9819	9826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018528	ATT	2	6	10110	10115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018528	T	6	6	10125	10130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018528	TGA	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018528	T	6	6	10185	10190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018528	A	6	6	10198	10203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018528	GGA	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018528	TAA	2	6	10222	10227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018528	A	6	6	10226	10231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018528	CTA	2	6	10238	10243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018528	TAAA	2	8	10253	10260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018528	GT	3	6	10262	10267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018528	AT	3	6	10591	10596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018528	TCAT	2	8	10660	10667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018528	TAA	2	6	10674	10679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018528	AT	3	6	10696	10701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018528	AGGA	2	8	10715	10722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018528	TTTTAT	2	12	14673	14684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018528	TATAA	2	10	14762	14771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018528	TAAT	2	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018528	T	6	6	14813	14818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018528	TCAT	2	8	14842	14849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018528	GGA	2	6	14859	14864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018528	CATTG	2	10	15808	15817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018528	AT	3	6	15860	15865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018528	A	6	6	15890	15895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018528	T	6	6	16875	16880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018528	GCA	2	6	16894	16899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018528	T	6	6	16922	16927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018528	A	6	6	17832	17837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018528	AAGA	2	8	17868	17875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018528	T	6	6	17889	17894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018528	AAGG	2	8	18002	18009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018528	ATC	2	6	18053	18058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018528	AAC	2	6	18071	18076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018528	TGA	2	6	18363	18368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018528	AAAC	2	8	18485	18492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018528	CAT	2	6	18495	18500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018528	TGG	2	6	18506	18511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018528	CAATT	2	10	18539	18548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018528	AAG	2	6	18562	18567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018528	CTC	2	6	18583	18588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018528	T	6	6	19062	19067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018528	AAT	2	6	19079	19084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018528	A	6	6	19090	19095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018528	AGT	2	6	19140	19145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018528	A	7	7	19158	19164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018528	CT	3	6	19572	19577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018528	ATT	2	6	20714	20719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018528	TTA	2	6	20926	20931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018528	GAAA	2	8	20942	20949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018528	GAT	2	6	20953	20958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018528	A	6	6	21235	21240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018528	T	6	6	22558	22563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018528	ATTT	2	8	23333	23340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018528	TTGAT	2	10	23354	23363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018528	T	6	6	23375	23380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018528	T	6	6	23385	23390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018528	A	7	7	23393	23399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018528	TAA	2	6	23427	23432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018528	TGT	2	6	23437	23442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018528	ATG	2	6	23501	23506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018528	ATTA	2	8	23536	23543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018528	T	6	6	23605	23610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018528	TGG	2	6	23698	23703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018528	T	6	6	23718	23723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018528	TAAA	2	8	23749	23756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018528	TA	3	6	23768	23773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018528	TAT	2	6	23781	23786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018528	A	6	6	23792	23797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018528	GATT	2	8	23855	23862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018528	T	6	6	23861	23866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018528	CCAG	2	8	24900	24907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018528	TTC	2	6	25066	25071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018528	T	6	6	25084	25089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018528	AATT	2	8	25140	25147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018528	TCAT	2	8	25155	25162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018528	A	6	6	25196	25201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018528	GTAA	2	8	25202	25209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018528	TAA	3	9	25207	25215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018528	TAT	2	6	25219	25224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018528	TAT	2	6	25243	25248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018528	ACT	2	6	25262	25267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018528	ATT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018528	AG	3	6	25325	25330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018528	ATTA	2	8	25404	25411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018528	AAT	2	6	25429	25434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018528	TAATAT	2	12	25507	25518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018528	AGAT	2	8	25524	25531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018528	TGG	2	6	25551	25556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018528	TTA	2	6	25595	25600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018528	A	7	7	25607	25613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018528	A	6	6	25641	25646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018528	GAT	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018528	TAA	2	6	25686	25691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018528	TTTA	2	8	26020	26027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018528	AAT	2	6	26030	26035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018528	TAAA	2	8	26782	26789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018528	AATT	2	8	26794	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018528	CTG	2	6	26814	26819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018528	CTA	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018528	TA	3	6	27015	27020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018528	TGT	3	9	27037	27045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018528	T	6	6	27070	27075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018528	TTTG	2	8	27088	27095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018528	AAT	2	6	27097	27102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018528	GCC	2	6	27113	27118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018528	AAT	2	6	27235	27240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018528	T	6	6	27245	27250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018528	ATT	2	6	27275	27280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018528	TGG	2	6	27300	27305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018528	ATAA	2	8	27404	27411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018528	ATT	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018528	TTTCA	2	10	27447	27456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018528	TA	3	6	27474	27479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018528	ATT	2	6	27484	27489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018528	A	6	6	27498	27503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018528	ATGG	2	8	27517	27524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018528	TGTA	2	8	27538	27545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018528	AAAT	2	8	27580	27587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018528	AAAG	2	8	27598	27605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018528	T	6	6	27615	27620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018528	ATT	2	6	27623	27628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018528	GTG	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018528	AAT	2	6	27661	27666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018528	A	6	6	27688	27693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018528	TAC	2	6	27705	27710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018528	ATT	2	6	27722	27727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018528	ATA	2	6	27734	27739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018528	ATT	2	6	27745	27750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018528	TAG	2	6	27787	27792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018528	AGG	2	6	27832	27837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018528	CTG	2	6	27879	27884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_018528	AGG	2	6	75888	75893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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